AVALIAÇÃO DE DIFERENTES TÉCNICAS PARA EXTRAÇÃO DIRETA DE DNA DE SOLO AGRICULTURÁVEL BRASILEIRO

Abstract

O solo é um ecossistema caracterizado pela sua grande complexidade e heterogeneidade, que o torna de difícil estudo, especialmente em relação à sua comunidade microbiana. Atualmente, ferramentas da biologia molecular têm sido utilizadas para o estudo de biodiversidade e descoberta de novas espécies, principalmente por meio da avaliação dos genes microbianos. A extração direta do DNA do solo é um importante passo nesse tipo de estudo, porém a maioria das técnicas desenvolvidas é aplicada para solos de clima temperado e poucos estudos têm sido feitos para o desenvolvimento de métodos para aplicação em solos brasileiros. Por esse motivo, este trabalho teve como objetivo avaliar nove diferentes técnicas para extração direta de DNA de solo sob cultura de cana-de-açúcar, em cultivo orgânico e convencional e propor modificações que resultem maior rendimento de DNA e menor custo. Bandas de DNA foram observadas somente com três técnicas (Selbach, Direito e kit comercial), duas delas já testadas anteriormente para solos tropicais. Os melhores resultados quanto ao rendimento em DNA (µg.g-1 solo) foram obtidos com os protocolos de Selbach e do kit comercial, porém estes resultados não diferiram estatisticamente daqueles obtidos com o protocolo aqui criado e proposto. Os melhores rendimentos em DNA foram encontrados em solo sob cultivo orgânico provavelmente devido à maior biomassa microbiana. O protocolo proposto apresentou melhores resultados em rendimento de DNA independentemente do solo utilizado e mostrou-se de mais fácil execução e de menor custo.